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民国元年（1912年）3月，临时参议院选举袁世凯为第二任临时大总统后，中华民国政府从南京北迁至前清故都北京，临时政府进入北京时期。1912年12月初至1913年3月，北京临时政府举行第一届国会大选。1913年4月8日，中华民国第一届国会在北京召开。在这段时间里，中华民国的中央政府体制逐渐确立，但国家政权也落入袁世凯等北洋派人士的掌握之中。至1913年10月6日，中华民国国会选举袁世凯为第一任大总统，但袁世凯日后意图恢复帝制未果。当时在各省设置的都督掌握了地方的政经与军事大权，成为日后军阀养成之温床。

1916年6月6日袁世凯猝逝后，无人有统御整个北洋派的能力，北洋派遂形成直系、皖系、奉系等三大派系为首的军阀势力；而自护国战争后，各地军阀也开始成型。各地军阀在名义上仍受北京的中央政府支配，但北京的中央政府实际上成为北洋军阀相互争夺权力的舞台。这也成为后世以“北洋”称之的主因。

在这段时间里，北洋军阀等各派势力操控下选出的中华民国大总统与国务总理所领导，以五色旗为国旗，以《卿云歌》为国歌，作为代表中国的符号和象征。在北洋军阀政府主导下，中华民国加入协约国参与第一次世界大战，并以“战胜国”的身份出席巴黎和会。

1925年，中国国民党成立国民政府，并且由蒋介石领军北伐。1928年12月29日，奉系领袖张学良除下五色旗、改挂青天白日满地红，并通电南京，表示接受国民政府管辖，史称东北易帜。至此，北洋军阀政府被迫结束运作，自然瓦解，北洋派退出历史舞台。

北洋军阀政府对外依靠英美帝国主义支持，对内主要代表国内汉族官绅势力，以北洋军队为统治支柱，发展民族经济和教育，实行舆论自由，在全国建立起自治化的统治。北洋军阀政府与北洋军各个派系的兴衰关系很密切，以时间划分，大致可分为袁世凯统治时期、皖系统治时期、直系统治时期、奉系统治时期四个阶段。

袁世凯统治时期

（1912～1916年）

1912年2月15日，袁世凯取得中华民国临时大总统一职，3月10日在北京就职，又逼南京临时政府迁往北京，这标志着民国史上北洋军阀政府统治的开始。

袁世凯上台后，临时政府进行改组，唐绍仪首任内阁总理，不少北洋官僚入阁。袁世凯为了清除革命势力，逼迫主张调和
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